过去，纳豆是人们在冬季农闲期在家自制的。严寒的冬季农活停止，农民们就稻草编织绳子，做成生活用品和纳豆的稻草包。另外还勤奋地制作味噌、腌菜等保存食品的同时，还制作纳豆，不仅用于自家食用，还可以贩卖。

基本的做法就只是将蒸煮过的大豆用稻草包起来保温，非常简单。保温有两种方法，只靠发酵产生的热量和用热水袋等加温，那种方法都体现出浓厚的地方色彩，简直就是与纳豆菌比较智慧。种类繁多可称为“乡土发酵”。其中有一直沿用到昭和初期的保温法。

秋田县“桧山纳豆”
将装入煮豆的稻草包填满木箱，撒上大量木屑并盖上稻草席，再压上重物发酵。

新潟县“桶纳豆”
将装入煮豆的稻草包排放在桶里，撒上大量稻草屑后用稻草席裹好。

东北地区“雪纳豆”
在雪下挖好1米见方的洞，铺上稻草屑。将装有煮豆的稻草包放入。插上作为通风口的管道，盖上雪保温。

埼玉县“灶门纳豆”
利用炉灶余热保温。煮饭后，将淋湿的稻草包放到炉灶里面还有余温的灰烬里。

山形县“吊挂纳豆”
装满煮豆的稻草包用稻草席包好，用绳子绑定稻草席的两端，悬挂在天花板上。利用地灶及炉灶上升的热气发酵。